Von den bereits hundert Jahren errichteten Sammlungen in der naturwissenschaftlichen Abteilung sind das Herbarium, die Sammlungen der Mollusken und anderen Käfergruppen nach wie vor kurrent. Die Sammlung repräsentiert am vollständigsten die Flora und Fauna von Süd-Transdanubien. Die Abteilung erwartet die Besucher 2001 und 2002 auch mit Sonderausstellungen.